لقد ذكرت مدينة برقين في العهد القديم باسم بيت فَلْوى وكانت إحدى البلدان التابعة لمملكة بلما التي تشرف غرباً على سهل دوثان وشمالاً على سهل يزرعيل احدى الممالك العبرانية القديمة والتي لا تزال اثارها ماثلة للعيان الى الجنوب الشرقي من القرية والتي تعرف حالياً باسم خربة بالعمة، حيث كانت بلدة قديمة ولما احتل نبوخذ نصر ارض فلسطين احتلوا أيضا هذه المدينة وضربوا معسكراتهم بقرب المدينة وكان آنذاك قائد جيش نبوخذ نصر أليفانا فكانت امرأة من بيت فلوى (برقين) اسمها يهوديت هذه استطاعت بذكائها وحيلتها أن تتعرف على أليفانا وان تزوره باستمرار فقد طلب منها شيوخ مدينتها لكي يتحرروا من جيوش نبوخذ نصر أن تقتل قائد جيوشه وهو أليفانا.

فعندما كانت تزوره كانت تدخل إلى خيامه بدون تفتيش وبدون قيود حتى استطاعت أن تدخل معها ذات يوم سلاحً وتقتل أليفانا قائد الجيوش بل وجلبت رأسه إلى شيوخ قبيلتها حيث تشجعوا بعد هذا الحدث أن يهاجموا جيوش نبوخذ نصر وينتصروا عليهم.وعندما اكتشفوا أن قائدهم أليفانا قد قتل خافوا وضعفت قوتهم وهزموا من قبل جيوش بيت فلوى.

وكانت تمتد بيت فلوى من مدينة برقين حاليا إلى مدينة جنين وكما يقال فهناك نفق يبدأ من الشارع الرئيسي الذي يوصل جنين مع نابلس فهناك أثارات على الشارع، نفق كبير يمتد إلى مدينة برقين حاليا وهذه من أثارات بيت فلوى (برقين حاليا).

وكانت أيضا مدينة برقين في أيام الرومانيين إذ يوجد بداخل الكنيسة أبار رومانية كثيرة يدل على أن الرومان سكنوها ووجد فيها أثار رومانية لهذا كانوا مرضى البرص الذين كان محرم في شريعة موسى يأتون ويقيمون في هذه الآبار خوفا من أن تنتقل العدوى إلى آخرين فكانوا يأتون ويلقون الطعام لهم والشراب من فتحات الآبار وكانوا من اليهود والسامرين وكل القبائل التي كانت تسكن فلسطين. لمشاهدة صور الكنيسة اضغط هنا